Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms