Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Timm44O35857 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Timm44O35857 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Timm44O35857 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Timm44O35857 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Timm44O35857 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Timm44O35857 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Timm44O35857 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Timm44O35857 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Timm44O35857 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Timm44O35857 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms