Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NudcO35685 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NudcO35685 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NudcO35685 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NudcO35685 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NudcO35685 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NudcO35685 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NudcO35685 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NudcO35685 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NudcO35685 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NudcO35685 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NudcO35685 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NudcO35685 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NudcO35685 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NudcO35685 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NudcO35685 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NudcO35685 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NudcO35685 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NudcO35685 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NudcO35685 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NudcO35685 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NudcO35685 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NudcO35685 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NudcO35685 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NudcO35685 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NudcO35685 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NudcO35685 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NudcO35685 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NudcO35685 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NudcO35685 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NudcO35685 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NudcO35685 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NudcO35685 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NudcO35685 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NudcO35685 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NudcO35685 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NudcO35685 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NudcO35685 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NudcO35685 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NudcO35685 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NudcO35685 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NudcO35685 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NudcO35685 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NudcO35685 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NudcO35685 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NudcO35685 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NudcO35685 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NudcO35685 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NudcO35685 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NudcO35685 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NudcO35685 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NudcO35685 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NudcO35685 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NudcO35685 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NudcO35685 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NudcO35685 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NudcO35685 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NudcO35685 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NudcO35685 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NudcO35685 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NudcO35685 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NudcO35685 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NudcO35685 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NudcO35685 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NudcO35685 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NudcO35685 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NudcO35685 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NudcO35685 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NudcO35685 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NudcO35685 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NudcO35685 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NudcO35685 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NudcO35685 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NudcO35685 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NudcO35685 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NudcO35685 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NudcO35685 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NudcO35685 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NudcO35685 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NudcO35685 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NudcO35685 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NudcO35685 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NudcO35685 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NudcO35685 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NudcO35685 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NudcO35685 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NudcO35685 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NudcO35685 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NudcO35685 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NudcO35685 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NudcO35685 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NudcO35685 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NudcO35685 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NudcO35685 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NudcO35685 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NudcO35685 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NudcO35685 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NudcO35685 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NudcO35685 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NudcO35685 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms