Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Foxd2O35392 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Foxd2O35392 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Foxd2O35392 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Foxd2O35392 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Foxd2O35392 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Foxd2O35392 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Foxd2O35392 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Foxd2O35392 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Foxd2O35392 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Foxd2O35392 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Foxd2O35392 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Foxd2O35392 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Foxd2O35392 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Foxd2O35392 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Foxd2O35392 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Foxd2O35392 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Foxd2O35392 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd2O35392 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Foxd2O35392 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Foxd2O35392 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxd2O35392 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxd2O35392 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxd2O35392 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxd2O35392 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxd2O35392 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms