Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe40O35185 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms