Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Nedd9O35177 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms