Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms