Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ArxO35085 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ArxO35085 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ArxO35085 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ArxO35085 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ArxO35085 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ArxO35085 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ArxO35085 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ArxO35085 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ArxO35085 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ArxO35085 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ArxO35085 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ArxO35085 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ArxO35085 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ArxO35085 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ArxO35085 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ArxO35085 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ArxO35085 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ArxO35085 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ArxO35085 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ArxO35085 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ArxO35085 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ArxO35085 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ArxO35085 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ArxO35085 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ArxO35085 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ArxO35085 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ArxO35085 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ArxO35085 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ArxO35085 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ArxO35085 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ArxO35085 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ArxO35085 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ArxO35085 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ArxO35085 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ArxO35085 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ArxO35085 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ArxO35085 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ArxO35085 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ArxO35085 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ArxO35085 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ArxO35085 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ArxO35085 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ArxO35085 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ArxO35085 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ArxO35085 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ArxO35085 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ArxO35085 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ArxO35085 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ArxO35085 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ArxO35085 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ArxO35085 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ArxO35085 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ArxO35085 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ArxO35085 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ArxO35085 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ArxO35085 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ArxO35085 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ArxO35085 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ArxO35085 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ArxO35085 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ArxO35085 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ArxO35085 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ArxO35085 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ArxO35085 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ArxO35085 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ArxO35085 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ArxO35085 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ArxO35085 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ArxO35085 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ArxO35085 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ArxO35085 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ArxO35085 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ArxO35085 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ArxO35085 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ArxO35085 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ArxO35085 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ArxO35085 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ArxO35085 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ArxO35085 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ArxO35085 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ArxO35085 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ArxO35085 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ArxO35085 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ArxO35085 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ArxO35085 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ArxO35085 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ArxO35085 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ArxO35085 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ArxO35085 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ArxO35085 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ArxO35085 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ArxO35085 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ArxO35085 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ArxO35085 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ArxO35085 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ArxO35085 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ArxO35085 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ArxO35085 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ArxO35085 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms