Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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