Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snap23O09044 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snap23O09044 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snap23O09044 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snap23O09044 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snap23O09044 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snap23O09044 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snap23O09044 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snap23O09044 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snap23O09044 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snap23O09044 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snap23O09044 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms