Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp2O08999 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltbp2O08999 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ltbp2O08999 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltbp2O08999 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltbp2O08999 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltbp2O08999 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltbp2O08999 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltbp2O08999 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltbp2O08999 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltbp2O08999 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltbp2O08999 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltbp2O08999 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltbp2O08999 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltbp2O08999 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltbp2O08999 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltbp2O08999 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltbp2O08999 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltbp2O08999 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltbp2O08999 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms