Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EllO08856 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EllO08856 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EllO08856 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EllO08856 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EllO08856 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EllO08856 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EllO08856 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EllO08856 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EllO08856 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EllO08856 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EllO08856 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EllO08856 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EllO08856 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EllO08856 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EllO08856 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EllO08856 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EllO08856 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EllO08856 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EllO08856 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EllO08856 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EllO08856 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EllO08856 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EllO08856 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EllO08856 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EllO08856 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EllO08856 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EllO08856 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EllO08856 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EllO08856 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EllO08856 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EllO08856 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EllO08856 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EllO08856 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EllO08856 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EllO08856 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EllO08856 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EllO08856 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EllO08856 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EllO08856 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EllO08856 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EllO08856 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EllO08856 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EllO08856 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EllO08856 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EllO08856 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EllO08856 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EllO08856 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EllO08856 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EllO08856 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EllO08856 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EllO08856 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EllO08856 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EllO08856 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EllO08856 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EllO08856 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EllO08856 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EllO08856 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EllO08856 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EllO08856 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EllO08856 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EllO08856 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EllO08856 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EllO08856 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EllO08856 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EllO08856 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EllO08856 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EllO08856 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EllO08856 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EllO08856 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EllO08856 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EllO08856 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EllO08856 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EllO08856 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EllO08856 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EllO08856 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EllO08856 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EllO08856 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EllO08856 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EllO08856 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EllO08856 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EllO08856 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EllO08856 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EllO08856 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EllO08856 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EllO08856 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EllO08856 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EllO08856 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EllO08856 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EllO08856 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EllO08856 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EllO08856 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EllO08856 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EllO08856 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EllO08856 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EllO08856 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EllO08856 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EllO08856 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EllO08856 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EllO08856 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms