Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms