Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mesp2O08574 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp2O08574 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms