Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec22bO08547 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms