Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsmbO08540 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsmbO08540 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsmbO08540 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MsmbO08540 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsmbO08540 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsmbO08540 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsmbO08540 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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