Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms