Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3415J3QMS8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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