Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm21863J3KMP8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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