Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf4bG5E8Z2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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