Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tubgcp6G5E8P0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms