Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms