Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Pcf11G3X9Z4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Pcf11G3X9Z4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms