Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r58G3X9U3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms