Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms