Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nccrp1G3X9C2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nccrp1G3X9C2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nccrp1G3X9C2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nccrp1G3X9C2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms