Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SprtnG3X912 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms