Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmigd3G3X8R9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms