Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Speer4cG3UXD1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4cG3UXD1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4cG3UXD1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4cG3UXD1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4cG3UXD1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4cG3UXD1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4cG3UXD1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4cG3UXD1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4cG3UXD1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4cG3UXD1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4cG3UXD1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4cG3UXD1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4cG3UXD1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4cG3UXD1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4cG3UXD1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4cG3UXD1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4cG3UXD1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4cG3UXD1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer4cG3UXD1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer4cG3UXD1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms