Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NpcdF8VQB8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms