Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ScaperF8VQ70 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms