Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms