Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
D430041D05RikF6ZGR6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms