Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms