Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm10378F6XQQ1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm10378F6XQQ1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm10378F6XQQ1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm10378F6XQQ1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm10378F6XQQ1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm10378F6XQQ1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm10378F6XQQ1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm10378F6XQQ1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm10378F6XQQ1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm10378F6XQQ1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm10378F6XQQ1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm10378F6XQQ1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm10378F6XQQ1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm10378F6XQQ1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms