Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms