Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms