Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms