Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.31■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.3■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
R3hdm1E9Q9Q2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms