Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms