Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5407E9Q7Q1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms