Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Susd1E9Q3H4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms