Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tarbp1E9Q368 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Tarbp1E9Q368 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms