Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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