Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms