Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ryr1E9PZQ0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms