Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc144bE9PVZ3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms