Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930558K02RikE0CXC6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
4930558K02RikE0CXC6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
4930558K02RikE0CXC6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
4930558K02RikE0CXC6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
4930558K02RikE0CXC6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
4930558K02RikE0CXC6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
4930558K02RikE0CXC6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
4930558K02RikE0CXC6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930558K02RikE0CXC6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930558K02RikE0CXC6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930558K02RikE0CXC6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930558K02RikE0CXC6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930558K02RikE0CXC6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930558K02RikE0CXC6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930558K02RikE0CXC6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930558K02RikE0CXC6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930558K02RikE0CXC6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930558K02RikE0CXC6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930558K02RikE0CXC6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930558K02RikE0CXC6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930558K02RikE0CXC6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
4930558K02RikE0CXC6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms