Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
5430403G16RikD3Z5L4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms