Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptrhd1D3Z4S3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptrhd1D3Z4S3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms